Alice (Mia Wasikowska) retorna ao País das Maravilhas, onde descobre que o Chapeleiro Maluco (Johnny Depp) corre risco de morte após fazer uma descoberta sobre seu passado. 

Para salvar o amigo, Alice deve conversar com o Tempo (Sacha Baron Cohen) para voltar às vésperas de um evento traumático e mudar o destino do Chapeleiro. 

Nesta aventura, também descobre um trauma que separou as irmãs Rainha Branca (Anne Hathaway) e a Rainha Vermelha (Helena Bonham Carter).